南海年会系列学术研讨会已成功举办11届，分别由厦门大学、广东海洋大学、香港中文大学、自然资源部第一海洋研究所、河海大学、中国科学院深海科学与工程研究所、复旦大学、广东海洋大学、江西师范大学、厦门大学（马来西亚分校）、大连海洋大学承办。本次年会是该系列会议的第12届，将于2025年10月10日-10月12日在南方科技大学举办。会议围绕南海及周边海域多尺度动力过程与跨尺度相互作用，南海与西北太平洋气候演变及多因子调控机制，南海海洋生物地球化学过程及其生态效应，海洋灾害的演变规律与智能预警技术，海洋科学新理论、新技术与跨学科融合等主题开展学术交流。会议特设口头报告与墙报展示两种学术交流形式，并特设青年学者论坛。